應用多任務學習於多相式電腦斷層掃描影像自動化切割與分類肝臟病灶

在肝臟疾病的診斷過程中,放射科醫師通常會利用多項式電腦斷層掃描影像來判斷肝臟病變,透過觀察、分析每個病灶在不同掃描項之間的顯影特性來確定病灶的位置與類別。然而,準確的診斷往往需要仰賴放射科醫師豐富的知識與長期累積的臨床經驗,考量到現今醫學人力資源短缺的情況下,這個診斷方式可能會增加醫療工作者的負擔,因此,電腦輔助診斷系統的發展愈來愈受到關注。
近年隨著電腦運算能力的提升與人工智慧技術的發展,愈來愈多領域開始應用機器學習和深度學習技術來推動自動化系統的開發,醫療領域亦不例外,而肝臟病灶的切割與分類相關研究更是不虞匱乏。由於多相式掃描相對於單項掃描能提供更為詳細且豐富多元的資訊,進而產生更為精確的結果,近期的相關研究主要偏向使用多項式電腦斷層掃描影像作為研究資料。然而,雖然現階段的研究皆能達到良好的準確率,但是大多數的研究都只關注單一任務,例如:偵測、切割、分類,這樣單一任務的方法在效率的提升上還有進一步優化的空間。
本論文引入了多任務學習的技術於肝臟疾病切割與分類之研究中。長期以來,由於收集到的資料量有限,訓練神經網路模型在病灶的分類上時常出現過擬合的問題,導致模型難以取得良好的結果。然而,透過多任務學習的特點成功解決了這個問題,因為多任務學習中的參數共享增強了模型的泛化能力,大幅減少過擬合的問題。此外,該多任務模型將切割與分類兩項任務整合到單一框架之中,進而提升了整體的效率。最終,為了評估所提出的多任務模型的有效性,我們將其與多種當前最先進的切割與分類模型於我們的資料上進行比較。結果顯示,我們的多任務模型在分類任務上優於其他模型,並在切割結果中取得與頂尖模型相當的性能。

應用多相式電腦斷層掃描影像偵測肝腫瘤

肝癌(肝腫瘤)長年位居台灣十大癌症死亡率第二名,目前診斷肝癌的方式可透過電腦斷層掃描影像(Computed Tomography,CT)以彌補血液檢查的不足且不具有侵入性。電腦斷層攝影主要是以注射顯影劑後,利用不同的顯影特性判別肝臟和肝癌區域,是現今廣泛使用確診肝癌的工具。放射科醫師透由顯影後產生三相式(Tri-phase:動脈階段、門靜脈階段、延遲階段)影像的亮度特徵診斷病症,連同原始影像將四張影像對齊後來回檢視以確認病徵,大部分的病例在電腦斷層檢查完畢後即可確診為肝癌,然此非常需要醫師的經驗且耗時費力。
近年來的深度學習模型中以H-Dense U-Net在切割肝癌影像上最為知名,然在單一相上須提供大量的訓練資料與人工標記樣本。本篇論文利用影像處理與機器學習來判別肝癌,並仿效放射師判斷肝癌的病徵的方式,在單一相上各僅需要一張影像,更為簡便。然而病患每次呼吸的進氣量不同,造成拍攝各階段間切片序號有些微誤差或產生影像位移,故影像對齊與校準扮演了關鍵因素。此研究計算每張影像之間的最小均方誤差找出相對應的切片序號以俾影像校準的匹配更為精準。後續再利用非剛性轉換中的微分同胚Demons將影像進行校正與對齊,經過對齊的程序後透過Liver Tumor Segmentation Challenge(LiTS)中的訓練資料集讓U-Net學習切割肝臟區域,經由輸入校準過的四張影像讓k-means對各像素點亮度變化做自動分群模擬出醫師判斷肝癌的病徵,最後將病徵作為讓DNN學習的訓練資料以辨識出健康肝臟、血管瘤以及肝癌。最終分析實驗結果驗證本論文所提出的架構與H-Dense U-Net的優缺點。

基於支持向量機裝置加速度計於腰間之步態分析

步態是一個描述擁有四肢動物移動行為的重要特徵,在神經醫學中步態扮演重要的角色,它提供神經及肌肉運作的資訊。步態疾病有三個主要的面向為感覺缺失、脊髓病變和巴金森氏症,本論文將以脊髓病變病人於走路行為提出量化分析的方法。本論文所採用的步態量測儀器為加速度計,由於加速度計有高取樣頻率、價格相較便宜及便利等等的優點,論文中步態的觀測重點為人行走時重心的變化,故將加速器設置於受測者腰間。步態特徵主要來自時域及時頻域,其中時頻域是以HHT方法轉換達成,資料觀測窗口是基於步態周期(gait cycle)切割,例如:「站立期(stancephase)」、「擺盪期(swing phase)」、「步伐(step)」、「步伐(stride)」。步態特徵萃取是源自觀測視窗資料之統計值,例如:「平均值」、「變異數」。並使用正交子空間投影(OSP)結合資訊理論方法,並以切割假定群組能力來排序特徵。由於不易蒐集大量脊髓型頸椎病(CSM)的案例,所以論文的分類器採用支持向量機(SVM),並透過實驗結
果證明本分類器可以提供優異的分類效能。

應用影像統計分析法量測腦脊髓液

神經外科中的腰椎椎管狹窄症主要是因為老化造成腰椎退化後,促使椎間孔局部或廣泛性的狹窄,因而讓腦脊髓液減少。該病症目前診斷的方式多是具有經驗的神經外科醫師以目測的方式判讀磁振造影影像。然而,若要定量化分析則必須以人工方式圈選腰椎椎管後,輔以軟體測量圈選範圍的面積,這樣的方式除了必須依靠醫生主觀經驗外,亦需要消耗龐大人力資源,難以建立量化的數據。

近年來因為人工智慧的蓬勃發展,電腦視覺與影像處理的技術在醫學影像上的應用更為廣泛應用,過去的參考文獻中曾利用腦脊髓液於磁振造影T1與T2上亮度作為分類特徵,透過非監督式分類器分割腦脊髓液並計算其區域面積。然而,此一方式假設訓練與測試樣本的亮度分布必須相似,否則將使得分類器效能大幅降低。

本論文將延續先前的研究成果進一步提出兩種方式,用以提升分割腦脊髓液區域的效能。第一種方式為頻帶擴展,此一技術利用了隨機程序的概念,將原始影像視為一隨機變數,並藉由不同隨機變數之間的關聯性以及非線性統計量產生新的波序,與原始波段合併後以補足缺乏之光譜值,藉此提升分類的效率。第二種方式為利用統計因子(Skewness)的非監督式影像門檻化演算法,此一方法導入了隨機變數的概念,配合動差生成函數(Moment Generating Function),有效地減低分類器在狹窄症嚴重等級較高案例的分類錯誤並提升效能。本論文於實驗設計中比較幾種不同方式的效能,其中包含頻帶擴展以增加特徵數量、深度學習中U-Net網絡以切割腦脊髓液、以及利用統計因子設計的影像門檻化演算法。實驗結果除了相互比較腦脊髓液的面積之外,並以腰椎狹窄症的病徵等級作為對應,藉以比較不同演算法之間的效能。

應用影像處理技術量測腦脊髓液

腰椎椎管狹窄症(Lumbar Spinal Stenosis),主要的成因為腰椎因退化而產生骨刺或黃韌帶肥厚造成腰椎體間結構的改變,促使脊髓管腔、椎間孔局部或廣泛性的狹窄,因而造成腦脊髓液的減少,其狹窄的結果會造成神經根或馬尾部神經受到壓迫,或局部的神經淤血產生臨床症狀。
目前的診斷方式大多為醫師透過核磁共振造影影像進行判斷,核磁共振造影由於運用射頻波激發體內水、脂肪中的氫原子共振進而產生不同強度的信號所製造出的影像,再利用弛緩時間差異產生的T1、T2成像圖,其中因為腦脊髓液反應在核磁共振造影的T2成像下較為明顯,因此醫生大多利用T2成像作腰椎椎管狹窄症的重要診斷依據。
目前腰椎椎管狹窄症多半透過醫生肉眼進行診斷,因此多半必須依靠個人經驗,難以建立量化數據,也無法追蹤術後的復原狀況。近年來由於電腦軟硬的快速發展,使得數位影像處理成為一個熱門的應用,先前的文獻中[1-2]透過影像處理的方式,利用腦脊髓液於T1與T2成像圖上的特徵,用以分類該區域並計算其面積。然而,之前的文獻所提出的演算法必須同時利用T1與T2成像的特徵,但是在實際的運作上,由於醫師多半僅利用T2成像進行診斷,因此許多案例所拍攝的磁振造影缺失T1成像圖,導致先前提出的演算法無法運作。
本論文為了克服T1成像所缺失的腦脊髓液之頻譜特徵,透過腦脊髓液於T2成像中的空間特徵,開發影像處理演算法來分類脊髓液的區域,並用以量測該區域面積。期待本研究的貢獻為醫生提供更準確的診斷工具,並且使病患得以於術後進行長期追蹤。

基於希爾伯特轉換之步態分析

步態是在現代醫療和診斷的重要指標,許多研究都以步態作為主要的研究主題,並嘗試將步態信號用於各項醫療用途。神經外科中,步態可以視為是由神經與肌肉的協調動作,隨著年齡增長,肌肉和神經的傳輸速度的強度之間將會減少。從醫學角度來說,步態可以當作一個指標作為神經系統的傷害或退化程度,所以建立客觀和定量化步態分析是相當重要的。
傳統的步態分析方法常只限於在實驗室環境,利用複雜儀器記錄人的步態動作,然而這些方法很難反應出現實生活中的步態。為了解決此限制,本論文研究如何透過現今普及的智慧型手機進行步態分析。所提出的方法利用智慧型手機中的三軸加速度傳感器採集步態信號,再利用三軸信號之間的關係將步態的七個週期區分出來,最後透過希爾伯特轉換分析步態信號在頻率域與時域之間的特徵。
本論文首先利用四種演算法將步態信號拆解為基本信號,四種演算法包含經驗模式分解(Empirical Mode Decomposition)、多變量經驗模式分解(Multivariate Empirical Mode Decomposition)、獨立成分析(Independent components analysis)、主成分分析(Principal components analysis),再透過希爾伯特轉換分析步態的頻率域與時域。本論文有兩大貢獻,第一個為探究智慧型手機用於步態分析的能力,第二個則是透過本論文提出的分析方法,找出重要的步態指標,用以提供醫護人員診斷上的重要依據。根據本論文的實驗中,可以驗證所提出的分析方法即使在低階的手機,也能夠找出重要的步態資訊與特徵,可做為醫護人員與患者長期追蹤的重要指標。

利用Kinect感應器估測熱量消耗量之研究-以室內有氧舞蹈為例

台灣的代謝症候群盛行率不亞於其他亞洲國家,有氧運動是一有效對抗代謝症候群的方法,室內的有氧運動不受外在天氣影響,其中有氧舞蹈簡單方便有趣更受大眾喜歡;但有氧舞蹈種類多且量測方法也有很多種,簡易使用運動時間來計算運動消耗量誤差很大,若採用 ”心跳率” 或 ”攝氧量” 來計算則需要將量測設備穿載在使用者身上量測,穿載式的設備會有穿載的規則性或限定性,若運動中設備偏移或脫落,會造成量測不正確,另外,尚有穿載上的不舒適及侵入性等問題。
本論文以Kinect感測器記錄測試者運動中的關節移動量,同時穿載上心跳帶利用心跳率來取得精準之運動消耗量,最後使用不同的迴歸法建立運動消耗量模型,進而找出最適合的運動消耗量模型。論文中透過多元迴歸法及支援向量迴歸法 (SVR) 來建立運動消耗量模型,比較線性回歸與多元回歸的模型,實驗結果發現支援向量迴歸法在建立模型的結果上,可使用較少資料建立一個可靠性較高的模型,並且準確性也高於其他模型。本論文共分為三階段模型,運動時間分別為30分鐘、20分鐘和10分鐘,其中有氧舞蹈消耗估測之平均錯誤率分別為:3.48%、3.66%和2.72%。由此一結果可以驗證所提出之模型在有氧舞蹈的消耗估測中為一個有效且準確之演算法。

以步態訊號分析比較正常人與頸椎受傷病人的差異

步態在醫療照護上及醫學上是一個相當重要指標,在神經外科中,步態可以視為是由神經與肌肉的協調動作,然而目前的醫學診斷方式,主要是以醫生的主觀判定,但因不同醫師的主觀判定而有所不同,難以建立長期的追蹤與察覺其細微的變化。
步態分析可以用來評估及測量人類走路的行為模式。近年來大多數相關研究專注於將步態資訊量化,用以尋找與其相關的病因,然而大多數的方法需要侷限測試者於預設的實驗空間,並利用精密的儀器蒐集與分析步態資料。此方式難以反應日常生活中的情況。為了解決此限制,本論文以智慧型手機內嵌三軸加速器作為收集資料的感測器,並且將頸椎受傷的病人作為實驗目標,收集步態信號,進一步分析病人於手術前後的步態信號差異,建立一個統計量表提供量化分析的依據,除了可以與醫學相關病徵做連結對應之外,並提供病人與家屬一個復原的指標。
本論文中利用步態訊號於三軸加速器之特性分割步態週期,以三種訊號處理分析演算法包括傅立葉轉換(Fourier Transform)、短時傅立葉轉換(Short-time Fourier transform)、希爾伯特-黃轉換(Hilbert-Huang Transform)經驗模態分解(EMD),並採用統機分析的方法,制訂量化標準來幫助判斷手術前於手術後的顯著區別。並期待本論文的貢獻於未來能夠提供醫護人員,與診療復健相關細微難以查覺的步態資訊外,並可以成為病人自身的參考指標。

使用線性與非線性分類演算法測量Spinal Canal 之 CSA

近年來,醫學影像技術不斷的蓬勃發展,其中核磁共振造影(Magnetic Resonance Imaging)技術逐漸成熟,使其在醫學診斷上被廣泛地利用;核磁共振造影利用磁場改變氫原子的排列方式分析接收其所釋放的電磁波,以達到繪製人體內部組織精確影像的目的,對於醫學診斷可提供重要的資訊。
脊椎狹隘症(Lumbar Spinal Stenosis)時常發生在65歲後的成年人身上,尤其是腰椎已經開始病變或退化的老人家,神經外科醫生必須透過核磁共振造影的成像來幫助其診斷病症,且在手術後的恢復狀況,也必須透過MR影像來判斷;通常醫生在觀察手術後的恢復情形時,必須透過一些市售的軟體以人工的方式對每一張核磁共振影像操作,此舉相當費時費力。
Cross section area of spinal canal是醫生用來判斷脊椎狹隘情形的重要指標,因此在本研究中,我們利用一些演算法包含k-NN、FLDA以及線性和非線性的SVM演算法以幫助圈選及量測該面積區域。由於該面積區域的形狀通常呈現不規則形而且核磁共振所能提供的頻譜資訊較少,本研究中方法雖然尚未能完全取代人工測量的方式,但未來可以成為準確的診斷工具。